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Text File  |  1995-03-04  |  1.3 KB  |  31 lines
  1. *************************************************
  2. * High potential iron-sulfur proteins signature *
  3. *************************************************
  4.  
  5. High potential iron-sulfur proteins (HiPIP) [1] are a specific class of  high-
  6. redox  potential  4Fe-4S  ferredoxins  that  functions  in  anaerobic electron
  7. transport and  which  occurs  in  photosynthetic  bacteria  and  in Paracoccus
  8. denitrificans.
  9.  
  10. The HiPIPs are  small  proteins  which show  significant  variation  in  their
  11. sequences, their sizes  (from 63 to 85 amino acids),  and  in their oxidation-
  12. reduction potentials.  As  shown in the following schematic representation the
  13. iron-sulfur cluster is bound by four conserved cysteine residues.
  14.  
  15.                            [ 4Fe-4S cluster]
  16.                            | |       |     |
  17.         xxxxxxxxxxxxxxxxxxxCxCxxxxxxxCxxxxxCxxxx
  18.                                      ********
  19.  
  20. 'C': conserved cysteine involved in the binding of the iron-sulfur cluster.
  21. '*': position of the pattern.
  22.  
  23. -Consensus pattern: C-x(7,9)-[LIVM]-x(3)-G-[YW]-C-x(2)-[YW]
  24.                     [The two C's are 4Fe-4S ligands]
  25. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  26. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  27. -Last update: December 1991 / First entry.
  28.  
  29. [ 1] Breiter D.R., Meyer T.E., Rayment I., Holden H.M.
  30.      J. Biol. Chem. 266:18660-18667(1991).
  31.